Scientists map genetic blueprints of childhood cancers using mouse models
Researchers have created the first comprehensive atlas of genetic changes in 31 types of pediatric tumors using engineered mice, revealing previously hidden patterns that drive cancer growth. The work could accelerate drug discovery and personalized treatment strategies for childhood cancers, offering pharmaceutical companies and hospitals new targets to pursue.
Originaltitel: Investigation of a global mouse methylome atlas reveals subtype-specific copy number alterations in pediatric cancer models
Forskare från tyska och amerikanska barnoncologicentra har skapat en omfattande methylom- och kopietalsatlas över 106 genetiska musmodeller för 31 typer av barncancer, inklusive 18 nya gliomamodeller. Atlanten möjliggör funktionell analys av kopietalvariationer (CNA) — strukturella chromosomförändringar som driver tumörbildning — och avslöjar att dessa följer subtypspecifika mönster kopplade till oncogener. Muztumörernas epigenetiska profiler överensstämmer med motsvarande humana sjukdomar, och forskarna identifierade konserverade syntena regioner mellan arternas tumörer. Denna systematiska kartläggning tillhandahåller nya translationella angreppspunkter för barnoncologin. För inköpschefer och läkare innebär detta tillgång till validerade preclinical-modeller för målidentifiering innan klinisk utveckling; för investerare öppnas vägar till tidigare biomarkörvalidering och reducerad utvecklingstid för pediatriska cancerterapier.
<p>Copy number alterations (CNAs) are hallmarks of cancer, yet investigation of their oncogenic role has been hindered by technical limitations and missing model systems. Here we generated a genome-wide DNA methylation and CNA atlas of 106 genetic mouse models across 31 pediatric tumor types, including 18 new models for pediatric glioma. We demonstrated their epigenetic resemblance to human disease counterparts and identified entity-specific patterns of immune infiltration. We discovered that mouse tumors harbor highly recurrent CNA signatures that occur distinctly based on the tumor subgroup and driving oncogene and showed that these CNAs share syntenic regions with the matching human tumor types, thereby revealing a conserved but previously underappreciated role in subgroup-specific tumorigenesis that can be analyzed using the presented models. Our study provides insights into globally available mouse models for pediatric solid cancers and enables access to functional CNA interrogation, with the potential to unlock new translational targets in pediatric cancers.</p>